1924 年（大正 13 年），臺灣總督府頒行漁業法、水產會法、漁業法施行規則、漁業組合令等法規，臺灣漁業組合乃由民間自由聚合的組織，變成具備法律依據的社團法人。

日治時期蘇澳鎮最早設置的漁業相關組織，為大正年間於北方澳成立的「有限責任北方澳漁業販賣購買 利用組合」。1927 年 （昭和 2 年） 依據日本漁業組合法令， 在南方澳漁港成立 「 蘇澳漁業組合 」 ，是現在蘇澳區漁會的前身，後改為 「 漁業協同組合 」 1943 年（昭和18 年）改名為「蘇澳漁業會」。

　　戰後光復初期， 1946 年（民國 35 年） 掌管漁業的是台灣省農林廳水產科，政府公布「台灣省合作組織財產整理辦法」，蘇澳漁會改組，劃分為「臺北縣蘇澳鎮漁會」及「臺北縣蘇澳漁業生產合作社」兩組織。政府於 1950 年（民國 39 年） 4 月，頒訂「台灣省各級漁會與漁業生產合作社合併改組規定」，將合作社併入漁會，同年 5 月 27 日改名為「宜蘭縣蘇澳鎮漁會」。1955 年（民國 44 年） 5 月 政府頒布改進全省各級漁會命令 依照「臺灣省各級漁會改進辦法」，蘇澳鎮漁會奉令改組， 於同年 7 月 15 日完成改組為「宜蘭縣蘇澳區漁會」。

　　1976 年（民國 65 年） 依照修正之漁會法及「臺灣省區漁會合併方案」， 與蘇澳區 漁會合併後改為「五結辦事處」 從此蘇澳區 漁會所轄範圍擴大 ，包括蘇澳鎮、五結鄉、冬山鄉、南澳鄉、三星鄉、大同鄉、羅東鎮七鄉鎮， 目前除了五結辦事處之外，另有新馬辦事處進行服務民眾。

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